El Fútbol Club Cartagena - La Unión nació en 2001 bajo el nombre "Club Deportivo La Unión". El año de su fundación consiguió el ascenso a Territorial Preferente, donde pasó algunos apuros el primer y segundo año, pero en 2004 se proclamó campeón, consiguiendo así el ascenso a Tercera División.
Debutó en la categoría con un magnífico 15º puesto y desde entonces luchó cada año por alcanzar un puesto de play-off de ascenso a Segunda B.
La temporada 2008/09 lo consigue por primera vez en la antepenúltima jornada al ganar por 3-0 al Jumilla en casa. Eliminó al Rayo Majadahonda que fue su primer rival en la primera eliminatoria de ascenso, empatando el primer partido 1-1 en La Unión y ganando en el Cerro del Espino por 0-1. En la segunda eliminatoria fue eliminado por el Noja.
Para la temporada 2009/10 pasa a ser equipo dependiente del FC Cartagena, y cambia su denominación a F.C. Cartagena-La Unión, cediéndole todas sus bases al F.C. Cartagena.
Plantilla del Fútbol Club Cartagena - La Unión 2009/2010
Dorsal | Jugador | Posición |
26 | Miguel | Portero |
45 | Óscar | Portero |
40 | Miguel Torres | Portero |
27 | Losana | Defensa |
28 | Aridane | Defensa |
29 | Bidari | Defensa |
30 | Samuel | Defensa |
31 | José Miguel | Defensa |
41 | José María | Defensa |
42 | Insa | Defensa |
43 | Felez | Defensa |
44 | Ivan | Defensa |
32 | Ángel | Centrocampista |
33 | Muñiz | Centrocampista |
35 | Toto | Centrocampista |
34 | Sánchez | Centrocampista |
36 | Carlos | Centrocampista |
46 | Nico | Centrocampista |
37 | Sergio | Delantero |
38 | Arturo | Delantero |
39 | Koeman | Delantero |